O troço das Lagoas estabelece a ligação entre a vila e o ribeiro da Silvareira, em Fontão. O percurso tem início junto à ponte Romano-Gótica, sita no centro da vila de Ponte de Lima, seguido pela margem do rio Lima até Bertiandos, onde se vislumbra o solar de Bertiandos através de uma alameda envolta por uma vinha de dimensão considerável. Próximo do solar, localiza-se uma das portas de entrada da Área Protegida das Lagoas de Bertiandos e S. Pedro d’Arcos.

Segue no sentido da área de lazer do souto de Bertiandos, onde a ecovia se afasta ligeiramente da margem do rio, em busca da travessia do rio Estorãos, afluente do rio Lima. Até ao ribeiro da Silvareira – ponto a partir do qual a ecovia segue por terras do concelho de Viana do Castelo –predomina a paisagem agrícola onde o milho é rei na primavera/verão.